We leveren fenotypische read- outs voor diagnose en patiënt stratificatie voor een behandeling op basis van innovatieve metabolomics, UPE en organ-on-a-chip technologie. Met een farmacologische én biologische aanpak bieden we inzicht in ziektemechanismen en vertalen dat voor de gepersonaliseerde gen…

De BioMedical Metabolomics Facility Leiden (BMFL) biedt een zeer gestructureerde omgeving voor geavanceerd metobolomicsonderzoek. BMFL is gebaseerd op volledig gevalideerde, moderne platforms die gezamenlijk het gehele menselijke metabolisme beslaan.

Promotor: T. Hankemeier, Co-promotor: T.H. Reijmers

Promotor: R. Verpoorte, Co-promotores: Y.H.Choi, N.R. Mustafa

The major and ultimate aim of metabolomics is to obtain an answer to a specific biological or clinical question.

The challenge of achieving fast quantification in metabolomics is the presence of severe matrix effects during the MS analysis of complex samples.

This thesis focuses on the development of sample-preparation methods for small amounts of samples and applying the developed methods to muscle tissues to investigate the mechanisms involved in sarcopenia.

The outbreaks of AIDS and COVID-19 showed clearly how infectious viruses can influence people’s lives. Investigating the changes in the host metabolism may provide a paradigm shift to consider immune-metabolic interactions as therapeutic targets.

Promotor: J. van der Greef; Co-promotor: E. van Wijk, M. Wang

Metabolomics is a powerful tool that can provide a comprehensive insight into the complexity of human biology and the pathophysiology of diseases. By analyzing the metabolome, which refers to the complete set of small (endogenous) molecules (with a mass <1500 Da) present within a given biological system,…

Promotores: T. Hankemeier; R. Berger, Co-promotor: R.J. Vreeken

Promotores: P.G.L. Klinkhamer, P.M. Brakefield, Co-Promotor: M. Bruinsma

Neurodegenerative diseases, including Parkinson’s disease (PD), are increasing in prevalence due to the aging population. Despite extensive study, these diseases are still not fully understood and the lack of personalised treatment options that can target the cause of the diseases, rather than the symptoms,…

Plant exudates appeared long time ago in the history line of life in the early Devonian. They are typical saps produced by specialized cells.

The progressive loss and degeneration of dopaminergic neurons is a major pathological hallmark of Parkinson's disease (PD). The onset and progression of PD can be triggered by multiple risk factors, for instance, genetic mutation, environmental exposure, and aging.

Promotor: G.P. van Wezel, Co-promotor: Y.H. Choi

Lipid signaling is an essential biological event/process in a plethora of pathophysiological conditions. The underlying idea of this thesis is that many of the roles and the complex interplay of the individual signaling lipids in inflammatory processes and related conditions in health and disease is…

Promotor: T. Hankemeier, Co-promotor: R.J. Vreeken

By growing in a soil plants change the biotic and abiotic properties of the soil in which they grow.

Climate change is a challenge for both current and future generations. New biological resources have to be developed in order to meet the demand for energy as well as the demand for food.

Op vrijdag 17 april opent de burgemeester van Leiden, de heer Lenferink, de Metabolomics Faciliteit van de Universiteit Leiden. Metabolomics onderzoek maakt veranderingen in de stofwisseling zichtbaar waardoor in de toekomst een diagnose beter, sneller en vroeger kan worden gesteld en het effect van…

Streptomyces bacteria are a valuable source of natural products, many of which are used in the clinic or in biotechnology.

Plant-microbe interaction resulted in different physio/chemical responses by host plant and interacting rhizobacteria.

Op 9 juli openende het nieuwe Medical Delta Fieldlab Phenomix haar deuren. In het fieldlab werken wetenschappers, zorginstellingen en bedrijven samen praktische toepassingen van metabolomics-onderzoek: onderzoek naar stofwisselingsproducten. Medical Delta sprak met de Leidse hoogleraar Thomas Hankemeier.…

We showed that constitutive and inducible chemical and morphological defenses against Western flower thrips differ between tomato and chrysanthemum plants.

Marlien van Mever verdiepte zich in de analyse van piepkleine monsters, bijvoorbeeld hersenvocht van transgene muizenmodellen. Ze valideerde methoden die daardoor nu bruikbaar zijn in het onderzoek naar hersenziekten als migraine en epilepsie. Van Mever promoveert 14 juni.

Promotor: J. van der Greef, T. Hankemeier; Co-promotor: H.A. van Wietmarschen

Factors affecting galanthamine production in Narcissus

Promotor: Prof.dr. T. Hankemeier, Co-promotor: Theo Reijmers

The power of personalized nutrition lies in being able to conduct clinical research on healthy people while capturing metabolic markers sensitive to the impact of environmental and metabolic stressors (e.g. diet, changing sex hormones and the menstrual cycle).

In this thesis, I study 1) metabolic alterations in tuberculosis related to wasting syndrome in human patients as well as in rodent and fish animal models. 2) effects of the mutation of the leptin gene on cachexia and diabetes in rodent and zebrafish animal models.

Promotor: Prof.dr. R. Verpoorte, Co-Promotores: N.R. Mustafa, A.E. Schulte

Marine sponges are important members of reef ecosystems, as they play ecological roles that are essential for the health of the reef.

Promotor: Prof.dr. T. Hankemeier

Promotor: T. Hankemeier, Co-Promotores: T. Reijmers, L. Coulier

Promotor: Prof.dr. R. Verpoorte, Co-Promotor: Dr. Young Hae Choi

The ideas underlying this thesis are that lipidomics may improve the diagnosis of liver metabolic diseases, and can provide further insights into the underlying pathophysiology of these diseases.

Heart failure is a major health care problem with high mortality.

Twee onderzoekers uit de onderzoeksgroep Plant ecology and Phytochemistry van het Instituut Biologie Leiden hebben beurs gekregen van de Stichting Technologische Wetenschappen.

Hoe komt het dat sommige coronapatiënten er veel slechter aan toe zijn dan anderen? En kunnen we van tevoren voorspellen wie van hen kritieke symptomen zullen ontwikkelen? Hoogleraar Thomas Hankemeier zoekt samen met een breed consortium van universiteiten, academische ziekenhuizen en industriële partners…

Promotor: Prof.dr. T. Hankemeier, Prof.dr. J.C.T. Eijkel (Twente University)

Drie projecten met Leidse onderzoekers ontvangen van NWO een subsidie voor de bouw of vernieuwing van grootschalige onderzoeksfaciliteiten. Zij gaan werken aan elektronenmicroscopie, een X-omics initiatief en een röntgentelescoop. De projecten maken deel uit van de Nationale Roadmap voor Grootschalige…

Vanuit een witleren fauteuil, waarop Barack Obama ooit zat, opende decaan Michiel Kreutzer het academisch jaar. Dit keer niet met bezoekers, maar volledig coronaproof via een livestream. In een huiselijke setting sprak Kreutzer met verschillende gasten, onder wie Covid-19-onderzoeker Thomas Hankemeier…

Hoogleraar Thomas Hankemeier heeft met zijn onderzoeksteam HYPERMARKER van Horizon Europe een beurs van 10 miljoen euro ontvangen.

Snelle en goedkope chips die extreem kleine hoeveelheden vloeistof (microfluïden) analyseren vormen de kern van gepersonaliseerde gezondheidszorg. Maar het ‘laboratorium op een chip’ is nog niet effectief genoeg. Dr. Paul Vulto en zijn onderzoeksteam ontwikkelden een techniek die het gebruik van microfluïdische…

Is het mogelijk om ziektes te diagnosticeren met behulp van moleculaire schakelaars? Over die vraag buigt het nieuwe internationale consortium LogicLab zich. Vanuit Leiden zijn scheikundige Sylvestre Bonnet en farmacoloog Thomas Hankemeier betrokken. Het project loopt voor vier jaar en krijgt ruim 3,5…

Door de stofwisseling te analyseren met behulp van big data-technieken kunnen we gezondheidsrisico’s vroeger signaleren. Thomas Hankemeier, hoogleraar Analytische Biowetenschappen bij het Leiden Academic Centre for Drug Research, vertelt erover.