Promotie
Algorithm for Structural Variant Detection
- J. Lin
- Datum
- vrijdag 24 juni 2022
- Tijd
- Bezoekadres
-
Academiegebouw
Rapenburg 73
2311 GJ Leiden
Promotor(en)
- Dr. W.A. Kosters
- Prof.dr. Kai Ye (Xi'an Jiaotong University)
Samenvatting:
Structural variant (SV), the hidden architecture of human genome, are critical for us to understand disease, evolution, etc. In this thesis, we introduce novel algorithms to detect and validate complex events, and assess the reproducibility of current SV detection pipelines for clinical and research settings. Chapter 1 begins with the introduction of DNA, various types of SVs and sequencing technologies. Then fundamental techniques or algorithms from computer science related to the thesis are briefly described. Pattern mining, graph and deep learning are applied to detect and characterize different type of complex SVs (CSVs) and they are all from computer science.
Proefschriften
Ongeveer een week na de promotie zijn proefschriften van Leidse promovendi digitaal beschikbaar via het Leids Repositorium. De proefschriften op deze site zijn vrij toegankelijk. Alleen in sommige gevallen rust er een tijdelijk embargo op een proefschrift en wordt het proefschrift pas later volledig beschikbaar gesteld.
Persvragen (alleen journalisten)
071 - 527 1521
nieuws@leidenuniv.nl
Algemene informatie
Bureau Pedel
pedel@bb.leidenuniv.nl
071 527 7211